Dans les eaux calmes du Golfe de Tadjourah, il existe plus de 200 espèces de coraux enregistrées, dont certaines sont endémiques de la région. Des récifs étendus couvrent une grande partie du littoral. Les espèces marines régulièrement vues au large de Djibouti sont largement similaires à celles trouvées dans le nord de la mer Rouge. Cependant, c'est l'abondance de la vie qui y est si impressionnante. Les grands bancs de barracudas sont souvent vus se nourrissant sur le récif. Les sites les plus connus sont près des îles de Moucha et Maskali, ou encore la baie de Ghoubet, où l'on trouve aussi de belles formations géologiques.

De novembre à janvier, il est possible de faire du snorkeling avec les requins baleines pendant la croisière.